RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC66	A2RUB6	948 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGCL	P35914	325 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ALS2CL	Q60I27	953 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SFRP1	Q8N474	314 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	STRADB	Q9C0K7	418 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NCN8	305 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE6	O95741	557 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RBL1	P28749	1068 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CD1C	P29017	333 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC25B	P30305	580 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A5	P35504	534 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA4	P43681	627 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FASLG	P48023	281 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RWDD2B	P57060	319 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTL9	Q8TC94	416 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GLYATL1	Q969I3	302 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRABD	Q9H4I3	376 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH14	Q9HBH5	336 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		21.55	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H423	210 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CHUK	O15111	745 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A1	P02730	911 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PYGM	P11217	842 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH4A1	P30038	563 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP3	Q13368	585 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SQSTM1	Q13501	440 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC1A5	Q15758	541 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	AADACL2	Q6P093	401 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	DPH1	Q9BZG8	443 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AG1	Q9H205	316 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		21.54	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0U1RQJ8	604 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C0C1	242 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GRID2	O43424	1007 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR89B	P0CG08	455 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	HGF	P14210	728 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5O	P48047	213 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	AMZ1	Q400G9	498 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	USP53	Q70EK8	1073 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PIM3	Q86V86	326 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	IPMK	Q8NFU5	416 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM159	Q96B96	161 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GBA3	Q9H227	469 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK6	Q9Y257	313 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		21.53	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZW10	O43264	779 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ACP5	P13686	325 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DPA1	P20036	260 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCNKA	P51800	687 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CFHR1	Q03591	330 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP9	Q49MG5	647 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	IYD	Q6PHW0	289 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1328	Q86T90	577 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS35	Q96QK1	796 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	IL26	Q9NPH9	171 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		21.52	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		21.51	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR19	A6NJB7	356 aa		21.51	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		21.51	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC181	Q5TID7	509 aa		21.51	■■□□□ 1.03

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