RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 FGF13Q92913 245 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SMARCD2Q92925 531 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 E2F7Q96AV8 911 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NXNL1Q96CM4 212 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 RMDN1Q96DB5 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CHFRQ96EP1 664 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 BIRC8Q96P09 236 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CITED4Q96RK1 184 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TCF12Q99081 682 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SORT1Q99523 831 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NDNQ99608 321 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 S1PR5Q9H228 398 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HPS4Q9NQG7 708 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 GDE1Q9NZC3 331 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 COPG2Q9UBF2 871 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 VWA7Q9Y334 891 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 A0A087X1B8 175 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 AGAP14A8MT82 685 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF195O14628 629 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TULP3O75386 442 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 IL2RAP01589 272 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SERPINE1P05121 402 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 APOA4P06727 396 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ADH5P11766 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CPA3P15088 417 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 STMN1P16949 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CTPS1P17812 591 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CD9P21926 228 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 KCNA5P22460 613 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HMGCLP35914 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SLC26A3P40879 764 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SLC6A11P48066 632 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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CAPN3-210ENST00000561817 SETDB1Q15047 1291 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ATG16L1Q676U5 607 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PIM3Q86V86 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 AHI1Q8N157 1196 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NAT16Q8N8M0 369 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CCDC63Q8NA47 563 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 RDH11Q8TC12 318 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SCRN2Q96FV2 425 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 MYADMQ96S97 322 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 P2RY12Q9H244 342 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 PIDD1Q9HB75 910 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 OXSMQ9NWU1 459 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 CLEC1BQ9P126 229 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HAO1Q9UJM8 370 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 TLK1Q9UKI8 766 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-210ENST00000561817 HCN2Q9UL51 889 aa6.5□□□□□ -1.37
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