RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TACC2	O95359	2948 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298		A0A1B0GUH1	482 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PSMD11	O00231	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SNX2	O60749	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RASSF9	O75901	435 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	EDN3	P14138	238 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	EPHB2	P29323	1055 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLC19A1	P41440	591 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MR1	Q95460	341 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MASP2	O00187	686 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF202	O95125	648 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ACP5	P13686	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	AMD1	P17707	334 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CAPN3	P20807	821 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CAPZB	P47756	277 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RRAD	P55042	308 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PKP1	Q13835	747 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	C19orf84	I3L1E1	186 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	PALM	O75781	387 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	SLC2A4	P14672	509 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	SSTR2	P30874	369 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	SCNN1B	P51168	640 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	CLCNKA	P51800	687 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	PTS	Q03393	145 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	KYNU	Q16719	465 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-208	ENST00000547298	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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