RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TRIB2	Q92519	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ADGRB2	O60241	1585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NEMF	O60524	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SERPINI2	O75830	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	RGS11	O94810	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	F9	P00740	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ABCD3	P28288	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CHAT	P28329	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	LMAN1	P49257	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CXCR3	P49682	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SLC8A3	P57103	927 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	HLF	Q16534	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TAF4B	Q92750	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PCNT	O95613	3336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ13	O60928	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CPD	O75976	1380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	NDUFB4	O95168	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	VNN2	O95498	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ACE	P12821	1306 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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