RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 OR2M4Q96R27 311 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 OR2AG1Q9H205 316 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC78A2IDD5 438 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 NUAK1O60285 661 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 OPA1O60313 960 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PYGLP06737 847 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SPAM1P38567 509 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SEMA5AQ13591 1074 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ARL10Q8N8L6 244 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 HACD3Q9P035 362 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 VPS18Q9P253 973 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PADI4Q9UM07 663 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX12Q9UMY4 172 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CHD8Q9HCK8 2581 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CHUKO15111 745 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SUN1O94901 812 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ECEL1O95672 775 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ACTR1BP42025 376 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CTSCP53634 463 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ACTR1AP61163 376 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 POU6F1Q14863 301 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC38Q502W7 563 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 XKR5Q6UX68 686 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PBKQ96KB5 322 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF778Q96MU6 729 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 VPS35Q96QK1 796 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNK6Q9Y257 313 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CEP295Q9C0D2 2601 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1W2PQM1 296 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PRR19A6NJB7 356 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GRID2O43424 1007 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SGTAO43765 313 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ACP5P13686 325 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ARSDP51689 593 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PDX1P52945 283 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TERF1P54274 439 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 B4GALNT1Q00973 533 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ILKQ13418 452 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 HS1BP3Q53T59 392 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF534Q76KX8 674 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CDH19Q9H159 772 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CASS4Q9NQ75 786 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RAD18Q9NS91 495 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms