RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490375.1

LNCSRLR-201, Transcript of lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LNCSRLR, Length 709 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNCSRLR-201ENST00000490375 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CHATP28329 748 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ACADLP28330 430 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TAS2R40P59535 323 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TFCP2Q12800 502 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ITGADQ13349 1161 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 NAE1Q13564 534 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GRAPQ13588 217 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CRY2Q49AN0 593 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 KRT80Q6KB66 452 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ZBTB2Q8N680 514 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MOAP1Q96BY2 351 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PAFAH2Q99487 392 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ZWILCHQ9H900 591 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.75□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 A0A0U1RQJ8 604 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GPC4O75487 556 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE7O76087 117 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 HIST1H2ABP04908 130 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TPOP07202 933 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE12FP0CL80 117 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE12GP0CL81 117 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE12IP0CL82 117 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MYBL1P10243 752 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TFPIP10646 304 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 HIST1H2ADP20671 130 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ITGB8P26012 769 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 SORDQ00796 357 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CXCL9Q07325 125 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE1Q13065 139 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAGE4Q13068 117 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CAPSQ13938 189 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 KCNC3Q14003 757 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ARHGEF6Q15052 776 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 IGSF8Q969P0 613 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 RTP4Q96DX8 246 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DGAT2Q96PD7 388 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DUX5Q96PT3 197 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 LHPPQ9H008 270 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MRGBPQ9NV56 204 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 COPG2Q9UBF2 871 aa4.74□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 NOTCH4Q99466 2003 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DENND3A2RUS2 1198 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TMEM202A6NGA9 273 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 WNT9BO14905 357 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 OGG1O15527 345 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GGPS1O95749 300 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CD58P19256 250 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 PEX5P50542 639 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GAS1P54826 345 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 KIF5AQ12840 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 TRAF3Q13114 568 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ALCAMQ13740 583 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 NFATC4Q14934 902 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CHST3Q7LGC8 479 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 GPATCH11Q8N954 259 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 LMO3Q8TAP4 145 aa4.73□□□□□ -1.65
LNCSRLR-201ENST00000490375 VPS33AQ96AX1 596 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms