RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489049.5

PDCD4-209, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDCD4, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-209ENST00000489049 AP1S1P61966 158 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SLC7A9P82251 487 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 UBE3AQ05086 875 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PRKAA1Q13131 559 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 POU6F1Q14863 301 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ACAP2Q15057 778 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SNCBQ16143 134 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CNGA3Q16281 694 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 MPPE1Q53F39 396 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 IL31Q6EBC2 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.356e-8■■■■□ 24.3
PDCD4-209ENST00000489049 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 RAPH1Q70E73 1250 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 HTR3DQ70Z44 454 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 USP33Q8TEY7 942 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SKA1Q96BD8 255 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ERP27Q96DN0 273 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CNDP1Q96KN2 507 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TTC1Q99614 292 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SEMA3CQ99985 751 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 C1orf21Q9H246 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 IL23AQ9NPF7 189 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 UBP1Q9NZI7 540 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 EMCNQ9ULC0 261 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 VWA7Q9Y334 891 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 INSL6Q9Y581 213 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 F5H423 210 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ADAM12O43184 909 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PIAS1O75925 651 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SEC24AO95486 1093 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 LRG1P02750 347 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CYBBP04839 570 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 HMBSP08397 361 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 RAG1P15918 1043 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 HDCP19113 662 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 AOC1P19801 751 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CR2P20023 1033 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CCND1P24385 295 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 HOXA9P31269 272 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TTPAP49638 278 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 KCNQ1P51787 676 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PLK1P53350 603 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 RCN2Q14257 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 DMC1Q14565 340 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 GRM3Q14832 879 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 PCLAFQ15004 111 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CRY1Q16526 586 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TCTN1Q2MV58 587 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 GAB4Q2WGN9 574 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 CFAP157Q5JU67 520 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-209ENST00000489049 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.62□□□□□ -1.35
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