RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	OR2M4	Q96R27	311 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	OR2AG1	Q9H205	316 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	VPS18	Q9P253	973 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		17.59	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	17.58	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902		B4DGG1	531 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CES2	O00748	559 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A9	O60656	530 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PROS1	P07225	676 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A6	P19224	532 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A1	P22309	533 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A4	P22310	534 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ACP1	P24666	158 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A3	P35503	534 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A5	P35504	534 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CTBS	Q01459	385 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SEMA5A	Q13591	1074 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PYCR3	Q53H96	274 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TTC25	Q96NG3	672 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	BOC	Q9BWV1	1114 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FRY	Q5TBA9	3013 aa		17.58	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CCDC78	A2IDD5	438 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MTX2	O75431	263 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KRT14	P02533	472 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CDH17	Q12864	832 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ITGA9	Q13797	1035 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TTC27	Q6P3X3	843 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GUSBP11	Q6P575	273 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ARL10	Q8N8L6	244 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	IFI44	Q8TCB0	444 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZNF398	Q8TD17	642 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	VPS35	Q96QK1	796 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	RMI1	Q9H9A7	625 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	APPL1	Q9UKG1	709 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PADI4	Q9UM07	663 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	17.57	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CCL22	O00626	93 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPR39	O43194	453 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GRID2	O43424	1007 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LDB2	O43679	373 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC6	O75061	913 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PHF2	O75151	1096 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CDK14	O94921	469 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF1	O95521	474 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF9	P0C862	333 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ACP5	P13686	325 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	HADHA	P40939	763 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ACTR1B	P42025	376 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GRIA1	P42261	906 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ACTR1A	P61163	376 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPS1	Q13098	491 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ILK	Q13418	452 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GTF2H3	Q13889	308 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CCDC38	Q502W7	563 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KY	Q8NBH2	561 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GATA6	Q92908	595 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ABCG4	Q9H172	646 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ASB8	Q9H765	288 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902		U3KQA8	63 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	USP24	Q9UPU5	2620 aa		17.56	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	VEGFD	O43915	354 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NUAK1	O60285	661 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	17.55	■□□□□ 0.4

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