RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 B4DGG1 531 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZW10O43264 779 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GRID2O43424 1007 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 LIASO43766 372 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 VEGFDO43915 354 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 NUAK1O60285 661 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CEP104O60308 925 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 NOBOXO60393 691 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 DNAJC6O75061 913 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TCEA3O75764 348 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 METTL18O95568 372 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CRTAMO95727 393 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFNB1P01574 187 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPR89BP0CG08 455 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 PNLIPP16233 465 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GLB1P16278 677 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 SPAM1P38567 509 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ACTR1BP42025 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ACTR1AP61163 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 PDE1BQ01064 536 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CYP4F3Q08477 520 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 BIRC2Q13490 618 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 SNX1Q13596 522 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 SPARCL1Q14515 664 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCNG2Q16589 344 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ST3GAL2Q16842 350 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 P3H1Q32P28 736 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 KYQ8NBH2 561 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 RTP4Q96DX8 246 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TTC25Q96NG3 672 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 VPS35Q96QK1 796 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR2AG1Q9H205 316 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 APPL1Q9UKG1 709 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 AK5Q9Y6K8 562 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 LAMA5O15230 3695 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHUKO15111 745 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A9O60656 530 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 USP12O75317 370 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CSO75390 466 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CDK14O94921 469 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ECEL1O95672 775 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 FGGP02679 453 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CAPNS1P04632 268 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A6P19224 532 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A1P22309 533 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A4P22310 534 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A3P35503 534 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 UGT1A5P35504 534 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 FDFT1P37268 417 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 GDF10P55107 478 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCL7P80098 99 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 OLIG2Q13516 323 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 ITGA9Q13797 1035 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 SPIDRQ14159 915 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 PTPRCAPQ14761 206 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 RTP5Q14D33 572 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHRNA6Q15825 494 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms