RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM114B3SHH9 223 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GCATO75600 419 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CYP7B1O75881 506 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 HGFP14210 728 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CAPGP40121 348 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CHRNA4P43681 627 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ENPEPQ07075 957 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RNF139Q8WU17 664 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 BEX2Q9BXY8 128 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TRIM15Q9C019 465 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CNGB3Q9NQW8 809 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MTMR10Q9NXD2 777 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 COQ3Q9NZJ6 369 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PSME2Q9UL46 239 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 INVSQ9Y283 1065 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ARPC2O15144 300 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RAD51BO15315 384 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GUCY1B2O75343 617 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CABYRO75952 493 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CKBP12277 381 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TPSB2P20231 275 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 S100A1P23297 94 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 AXLP30530 894 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PLA2G16P53816 162 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TPI1P60174 286 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 EPS8Q12929 822 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TPSAB1Q15661 275 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 COLEC12Q5KU26 742 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TBPL2Q6SJ96 375 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ZYG11AQ6WRX3 759 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TIFABQ6ZNK6 161 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 AKAP14Q86UN6 197 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RETREG3Q86VR2 466 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 FEM1CQ96JP0 617 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 VRTNQ9H8Y1 702 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RASSF1Q9NS23 344 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TET1Q8NFU7 2136 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SZT2Q5T011 3432 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MPOP05164 745 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CYP4F2P78329 520 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CYP4F3Q08477 520 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GTF2H3Q13889 308 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MBTPS1Q14703 1052 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SYT16Q17RD7 645 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SPATC1Q76KD6 591 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 KDM1BQ8NB78 822 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ZMIZ2Q8NF64 920 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 NDNFQ8TB73 568 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 RDH11Q8TC12 318 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TRPC4APQ8TEL6 797 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CHPT1Q8WUD6 406 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SLAMF8Q9P0V8 285 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SRRDQ9UH36 339 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 UNCXA6NJT0 531 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GABRB3P28472 473 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PNPLA4P41247 253 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MAP2K4P45985 399 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 NCS1P62166 190 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TNK2Q07912 1038 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PFKFB4Q16877 469 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 INSCQ1MX18 579 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GLB1LQ6UWU2 654 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 METTL23Q86XA0 190 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 LSMEM2Q8N112 164 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 PAF1Q8N7H5 531 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CALML6Q8TD86 181 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 GIPC2Q8TF65 315 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 DHRS1Q96LJ7 313 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CHID1Q9BWS9 393 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 MKS1Q9NXB0 559 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TRAF6Q9Y4K3 522 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 SNX8Q9Y5X2 465 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRN-202ENST00000409251 KCNE1P15382 129 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms