RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 STK39Q9UEW8 545 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PADI1Q9ULC6 663 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRCP08575 1304 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 LILRA5A6NI73 299 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 AGAP14A8MT82 685 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 MYOD1P15172 320 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMB10P40306 273 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 CASP2P42575 452 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 SFR1Q86XK3 245 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 THAP6Q8TBB0 222 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 CDCA5Q96FF9 252 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 QRFPRQ96P65 431 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 CSTL1Q9H114 145 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 EBF2Q9HAK2 575 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBA1AQ71U36 451 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR180Q86V85 440 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGTQ969N2 578 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
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RABGGTB-202ENST00000370826 ERVFC1-1P60608 527 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC96Q2M329 555 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB41Q5JT25 222 aa3.77□□□□□ -1.81
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