RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 APOL2Q9BQE5 337 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CARD9Q9H257 536 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 APPL1Q9UKG1 709 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKAB1Q9Y478 270 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 AK5Q9Y6K8 562 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 DSPP15924 2871 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 NUAK1O60285 661 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ECEL1O95672 775 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PNLIPP16233 465 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CCL7P80098 99 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ATG4AQ8WYN0 398 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 VPS35Q96QK1 796 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 OR2AG1Q9H205 316 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1W2PQM1 296 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GRID2O43424 1007 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 USP12O75317 370 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 SPAM1P38567 509 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GDF10P55107 478 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PARP6Q2NL67 630 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CCNJLQ8IV13 435 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL14Q8N4G2 192 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 DTX3LQ8TDB6 740 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 IL26Q9NPH9 171 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PKP3Q9Y446 797 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR89AB7ZAQ6 455 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 D6RAR5 112 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CHUKO15111 745 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PPFIA2O75334 1257 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KRT37O76014 449 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 METTL18O95568 372 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR89BP0CG08 455 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ACP5P13686 325 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PDX1P52945 283 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 SPARCL1Q14515 664 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KCTD11Q693B1 232 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 DENND5AQ6IQ26 1287 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF438Q7Z4V0 828 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 SPRED1Q7Z699 444 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM58Q8NG06 486 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNK6Q9Y257 313 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL5AQ9Y689 179 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP5-201ENST00000366391 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 LIASO43766 372 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 VEGFDO43915 354 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 BRINP1O60477 761 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 MTX2O75431 263 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 EML2O95834 649 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 MPOP05164 745 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 B4GALNT1Q00973 533 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPRCAPQ14761 206 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 OASLQ15646 514 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 CHRNA6Q15825 494 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 P3H1Q32P28 736 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM151BQ6UXP7 276 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC45Q96CN5 670 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 RTP4Q96DX8 246 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 RAXQ9Y2V3 346 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 C2orf81A6NN90 581 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 PPM1DO15297 605 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP5-201ENST00000366391 LSSP48449 732 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms