RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 UBP1Q9NZI7 540 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 TREHO43280 583 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 APLP1P51693 650 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R39P59534 338 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DAG1Q14118 895 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 C19orf60Q96EN9 201 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.72■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DYRK3O43781 588 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 MGEA5O60502 916 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 KCNK2O95069 426 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DLGAP3O95886 979 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ALPLP05186 524 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 CDH1P12830 882 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 AGXTP21549 392 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SERPINB10P48595 397 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 BCAT1P54687 386 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 VBP1P61758 197 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 IL31Q6EBC2 164 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 RNF139Q8WU17 664 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DACH2Q96NX9 599 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 TOR3AQ9H497 397 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SP140LQ9H930 580 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 NTN4Q9HB63 628 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 USP22Q9UPT9 525 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 PTGES3LE9PB15 166 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A1O15245 554 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 HUS1O60921 280 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ITIH1P19827 911 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 BEX3Q00994 111 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 KCTD11Q693B1 232 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 STK32CQ86UX6 486 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 TP53INP1Q96A56 240 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 VPS33AQ96AX1 596 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 CPA4Q9UI42 421 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 DERAQ9Y315 318 aa16.71■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 SEC24AO95486 1093 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MYL3P08590 195 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB1P25685 340 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PHC1P78364 1004 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 LIPEQ05469 1076 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ADIGQ0VDE8 80 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 FUT11Q495W5 492 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 UNC93AQ86WB7 457 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DEFB106AQ8N104 65 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PTPN18Q99952 460 aa16.71■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 BRCA2P51587 3418 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TTC34A8MYJ7 566 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 M0QX08 132 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CYP2B6P20813 491 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CASP3P42574 277 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SEPHS1P49903 392 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 APPL2Q8NEU8 664 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TMBIM1Q969X1 311 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 YME1L1Q96TA2 773 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 BTBD2Q9BX70 525 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PIF1Q9H611 641 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PIRO00625 290 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 KPNA6O60684 536 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 BEST1O76090 585 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 GSNP06396 782 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PCMT1P22061 227 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NDUFV1P49821 464 aa16.7■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 OSTM1Q86WC4 334 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms