RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038514.14

Nup54-201, Transcript of Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nup54, Length 2,352 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54-201ENSMUST00000038514 Faf1P54731 649 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Polr2iP60898 125 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pla2g5P97391 137 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Jak3Q62137 1100 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fmo9Q8C116 539 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nrn1lQ8C4W3 162 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pnpla8Q8K1N1 776 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Stk32cQ8QZV4 488 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 BfarQ8R079 450 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sirt3Q8R104 334 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mtmr14Q8VEL2 648 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 EedQ921E6 441 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Eef1akmt2Q9D853 244 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 SgshQ9EQ08 502 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Insl5Q9WUG6 135 aa14.91□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Obox5G3X9P6 291 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fbln2P37889 1221 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ndst2P52850 883 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 SobpQ0P5V2 864 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 XpaQ64267 272 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dclk2Q6PGN3 756 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm7247Q6UY52 187 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr834Q7TRG8 312 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr667Q7TRP4 326 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pnma8aQ80VM8 430 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Arl5aQ80ZU0 179 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 FicdQ8BIX9 458 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sfr1Q8BP27 319 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 BicralQ8CHH5 1074 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fam83aQ8K2P2 436 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc22a7Q91WU2 540 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lrrc17Q9CXD9 443 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slco6d1Q9D5W6 683 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 P33monoxQ9DBN4 303 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Padi4Q9Z183 666 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Plxna3P70208 1872 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mcf2A2AEU1 1111 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp938E9Q9G3 579 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ncam2O35136 837 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 ApoeP08226 311 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hoxc8P09025 242 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nedd8P29595 81 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 InaP46660 501 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Akr1c6P70694 323 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 SbplQ3TUY3 232 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cd300aQ6SJQ0 318 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dnajc15Q78YY6 149 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kctd11Q8K485 232 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mmgt2Q8R3L0 123 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cant1Q8VCF1 403 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gstt3Q99L20 241 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Snrnp48Q9D361 337 aa14.9□□□□□ -0.02
Nup54-201ENSMUST00000038514 Wdr81Q5ND34 1934 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm3604A0A087WPN2 559 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ankrd16A2AS55 361 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Erich1E9PY43 332 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Irs1P35569 1233 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc11a2P49282 568 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ufm1P61961 85 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rps17P63276 135 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Smpd1Q04519 627 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ifi47Q61635 420 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lrrc8eQ66JT1 795 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Prdx6bQ8BG37 224 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Noc4lQ8BHY2 516 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fastkd3Q8BSN9 661 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vps50Q8CI71 964 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 LzicQ8K3C3 190 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 IlkapQ8R0F6 392 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Capn8Q91VA3 703 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 NlnQ91YP2 704 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slco1a5Q91YY5 670 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 AasdhpptQ9CQF6 309 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Art4Q9CRA0 300 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Q9D1K7 174 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ribc2Q9D4Q1 309 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dhx34Q9DBV3 1145 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 PtsQ9R1Z7 144 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mroh7A2AVR2 1279 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr1022L7MTT3 315 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 C1qbP14106 253 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 PthlhP22858 175 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Naa20P61600 178 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pnrc1Q3TWH3 297 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kansl1lQ5DTI6 991 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Map3k10Q66L42 940 aa14.89□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ubtd2Q6PGH0 234 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms