RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558094.1

PSMA4-204, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PSMA4, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-204ENST00000558094 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PSMA4-204ENST00000558094 CTAGE9A4FU28 777 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CAVIN2O95810 425 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CTAGE8P0CG41 777 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ZNF613Q6PF04 617 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SNAPC3Q92966 411 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 C3orf49Q96BT1 292 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NSD3Q9BZ95 1437 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 STRCP1A6NGW2 1772 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 RGPD5Q99666 1765 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CD163L1Q9NR16 1453 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.4□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 KLRF2D3W0D1 207 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PI15O43692 258 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 MMP2P08253 660 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CHATP28329 748 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PNPLA4P41247 253 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 IGBP1P78318 339 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PEX6Q13608 980 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 FAM171BQ6P995 826 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 OR2C3Q8N628 320 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 FSIP1Q8NA03 581 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ATP7BP35670 1465 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PIK3C2AO00443 1686 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PEAK1Q9H792 1746 aa3.39□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TECPR2O15040 1411 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ACTL6BO94805 426 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 MYL3P08590 195 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 G6PDP11413 515 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PNLIPRP1P54315 467 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TUBB2AQ13885 445 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 FAM71BQ8TC56 605 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 GRHL3Q8TE85 626 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PCYT2Q99447 389 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 KNSTRNQ9Y448 316 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 MED14O60244 1454 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 EVC2Q86UK5 1308 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NWD1Q149M9 1564 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 A0A1W2PP64 1363 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 INSRP06213 1382 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 METP08581 1390 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TMEM2Q9UHN6 1383 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.38□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 IQSEC2Q5JU85 1478 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CBY3A6NI87 242 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 SYNGR3O43761 229 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CD58P19256 250 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PPP2R1AP30153 589 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 RUNX2Q13950 521 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PRAM1Q96QH2 718 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 CMKLR1Q99788 373 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 STK26Q9P289 416 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 NSD2O96028 1365 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 ABCC11Q96J66 1382 aa3.37□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 FAM135BQ49AJ0 1406 aa3.36□□□□□ -1.87
PSMA4-204ENST00000558094 PTPRUQ92729 1446 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms