RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 LRP8Q14114 963 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF563Q8TA94 476 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf74Q96LT6 269 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRB-209ENST00000550857 DACH2Q96NX9 599 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-209ENST00000550857 KCND3Q9UK17 655 aa8.01□□□□□ -1.13
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