RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 HMGCLP35914 325 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PYCR3Q53H96 274 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SFTPA2Q8IWL1 248 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TRAM1L1Q8N609 369 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 HACD3Q9P035 362 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 VPS18Q9P253 973 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 KNTC1P50748 2209 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 AKAP13Q12802 2813 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SPEGQ15772 3267 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CAPNS1P04632 268 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ADRA1AP35348 466 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 OLIG2Q13516 323 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GALNT13Q8IUC8 556 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 APOL2Q9BQE5 337 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.68■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 DNAJC6O75061 913 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GDF10P55107 478 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 RANBP10Q6VN20 620 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 MDM1Q8TC05 714 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CARD9Q9H257 536 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CASC3O15234 703 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ACTR1BP42025 376 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ACTR1AP61163 376 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TRIM58Q8NG06 486 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GLYATL1Q969I3 302 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 RMI1Q9H9A7 625 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 IL17CQ9P0M4 197 aa21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CSO75390 466 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SPARCL1Q14515 664 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PARP6Q2NL67 630 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.65■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 LIASO43766 372 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 NUAK1O60285 661 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 USP12O75317 370 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 METTL18O95568 372 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 GLB1P16278 677 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 SPAM1P38567 509 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 CYP4F3Q08477 520 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 LRP8Q14114 963 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 WDR48Q8TAF3 677 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 TLR10Q9BXR5 811 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 OR2AG1Q9H205 316 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 IL26Q9NPH9 171 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 PKP3Q9Y446 797 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.64■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 IGF2RP11717 2491 aa21.63■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 GRID2O43424 1007 aa21.63■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 ECEL1O95672 775 aa21.63■■□□□ 1.05
PUS1-211ENST00000544662 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms