RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 C5orf60A6NFR6 353 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 B4DGG1 531 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 E7EVH7 732 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF103O00237 685 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 QSOX1O00391 747 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PFDN6O15212 129 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KMOO15229 486 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SPINT1O43278 529 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN12O43309 604 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K7O43318 606 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 VEGFDO43915 354 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PMPCBO75439 489 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN7O95471 211 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKCGP05129 697 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PDHA1P08559 390 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RBP3P10745 1247 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CTPS1P17812 591 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN3P26045 913 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTR1BP42025 376 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HALP42357 657 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GNPDA1P46926 289 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LSSP48449 732 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LMAN1P49257 510 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTR1AP61163 376 aa5.57□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SKOR1P84550 965 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RALGDSQ12967 914 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf61Q13536 156 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DS5Q14953 304 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NOMO1Q15155 1222 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6KA1Q15418 735 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC1A5Q15758 541 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TAZQ16635 292 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 QPCTQ16769 361 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ALG11Q2TAA5 492 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL35Q6PF15 583 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC89Q8N998 374 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G6Q8NH81 332 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT35Q92764 455 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ULK4Q96C45 1275 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CRELD1Q96HD1 420 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2M4Q96R27 311 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A3Q99624 504 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DPH1Q9BZG8 443 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CARD9Q9H257 536 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SUFUQ9UMX1 484 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAQ8IWI9 3026 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM202A6NGA9 273 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNN4O15554 427 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GRID2O43424 1007 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KDM1AO60341 852 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 USP12O75317 370 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CSO75390 466 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GCATO75600 419 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK14O94921 469 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K6O95382 1288 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CPNE6O95741 557 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CEACAM5P06731 702 aa5.56□□□□□ -1.52
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