RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	POLB	P06746	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	INHBA	P08476	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CLDN20	P56880	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TAF12	Q16514	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	BAK1	Q16611	211 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	APBB2	Q92870	758 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TAF1	P21675	1872 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SYNGR3	O43761	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ABCD1	P33897	745 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CPOX	P36551	454 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TERF1	P54274	439 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ACOX2	Q99424	681 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN4	O14817	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CTSV	O60911	334 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	F9	P00740	461 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	UBA7	P41226	1012 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HSD17B4	P51659	736 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TRPC3	Q13507	836 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVY2	172 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PP11	408 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PCDH7	O60245	1069 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	RNF224	P0DH78	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	GNB1	P62873	340 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DCST1	Q5T197	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	GPR180	Q86V85	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HTRA1	Q92743	480 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.1	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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