RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 POLG2Q9UHN1 485 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 PADI3Q9ULW8 664 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SNAP23O00161 211 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 KCNN4O15554 427 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF23P17027 643 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 VEGFCP49767 419 aa4.93□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CDC73Q6P1J9 531 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 ABI3Q9P2A4 366 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PRG0 241 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 HS3ST1O14792 307 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ZG16O60844 167 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 IGHV4-39P01824 125 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SERPINB2P05120 415 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 KRT10P13645 584 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 UGT1A1P22309 533 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 UBA7P41226 1012 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ATP12AP54707 1039 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 FAM76AQ8TAV0 307 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.92□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 CLDN20P56880 219 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 CCNG2Q16589 344 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 TSSK4Q6SA08 328 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 MAP7D2Q96T17 732 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-221ENST00000514231 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD28O15084 1053 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 PCDH7O60245 1069 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-221ENST00000514231 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SEC14L2O76054 403 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 TUBBP07437 444 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-221ENST00000514231 DCTP40126 519 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-221ENST00000514231 PLIN5Q00G26 463 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF524Q96C55 264 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 LINGO1Q96FE5 620 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 C17orf77Q96MU5 243 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 SIL1Q9H173 461 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-221ENST00000514231 MKLN1Q9UL63 735 aa4.9□□□□□ -1.63
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