RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 MAP3K6O95382 1288 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CYP1A2P05177 515 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CCNCP24863 283 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 DSC2Q02487 901 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CATSPER2Q96P56 530 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 RMI1Q9H9A7 625 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO8Q9NRD0 319 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TBC1D29Q9UFV1 150 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CHKBQ9Y259 395 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NBASA2RRP1 2371 aa29.93■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 SMTNL1A8MU46 457 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CLDN7O95471 211 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 EPHA4P54764 986 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 POLE2P56282 527 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 HHEXQ03014 270 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 KCNAB2Q13303 367 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 DPYSL3Q14195 570 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZPBPQ9BS86 351 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ANAPC7Q9UJX3 599 aa29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 INPP4BO15327 924 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 MBD3O95983 291 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF165P49910 485 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 EPHB1P54762 984 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NIPAL4Q0D2K0 466 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 FAM129CQ86XR2 697 aa29.91■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.381e-6■■■■■ 41.7
ALYREF-202ENST00000505490 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 SPINT3P49223 89 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TLE1Q04724 770 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ITKQ08881 620 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 KRT81Q14533 505 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NLGN4XQ8N0W4 816 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 SH3KBP1Q96B97 665 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 FAF2Q96CS3 445 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 HERPUD2Q9BSE4 406 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 NUP85Q9BW27 656 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM63CQ9P1W3 806 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRG1Q9Y653 693 aa29.9■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PQJ5 194 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 RGSL1A5PLK6 1076 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 FADS2P1A8MWK0 482 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CLCNKAP51800 687 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC122Q5T0U0 273 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF670Q9BS34 389 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 EPB41L1Q9H4G0 881 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 PCDH9Q9HC56 1237 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 PRKAB1Q9Y478 270 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 LRRK2Q5S007 2527 aa29.89■■■□□ 2.38
ALYREF-202ENST00000505490 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 A0A0G2JNG1 304 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 KIR2DS3K7RE56 304 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 ASMTLO95671 621 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 HLA-DQB2P05538 268 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 MMP2P08253 660 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 PBX1P40424 430 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 CCR10P46092 362 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 ABHD18Q0P651 414 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 KIR2DS5Q14953 304 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 CEACAM20Q6UY09 585 aa29.88■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 MYO1FO00160 1098 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 F3P13726 295 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 CA4P22748 312 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 QPCTQ16769 361 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 SLC9B2Q86UD5 537 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 EFHD1Q9BUP0 239 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 CARD9Q9H257 536 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 FAM83DQ9H4H8 585 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 HAUS2Q9NVX0 235 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 NENFQ9UMX5 172 aa29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 A0A087X0T9 212 aa29.86■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 LILRA5A6NI73 299 aa29.86■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 OR5K4A6NMS3 321 aa29.86■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD66B4E2M5 251 aa29.86■■■□□ 2.37
ALYREF-202ENST00000505490 NKX2-8O15522 239 aa29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms