RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SLC1A5Q15758 541 aa23.79■■□□□ 1.4
SMKR1-201ENST00000462322 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 WDR48Q8TAF3 677 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 TRABDQ9H4I3 376 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.78■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.78■■□□□ 1.4
SMKR1-201ENST00000462322 HACD3Q9P035 362 aa23.78■■□□□ 1.4
SMKR1-201ENST00000462322 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SMKR1-201ENST00000462322 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.78■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 PSMB4P28070 264 aa23.77■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 ACTR1AP61163 376 aa23.77■■□□□ 1.4
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SMKR1-201ENST00000462322 PKD1L2Q7Z442 2459 aa23.75■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 OR2AG1Q9H205 316 aa23.74■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.74■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.74■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 C5orf60A6NFR6 353 aa23.73■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 NUAK1O60285 661 aa23.73■■□□□ 1.39
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