RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	FZD6	O60353	706 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LRCH4	O75427	683 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TRBC1	P01850	177 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	FER	P16591	822 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF30	P17039	623 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	AMPD1	P23109	780 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	DLST	P36957	453 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	VPS18	Q9P253	973 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445		A6NCN8	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	KRT7	P08729	469 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	FURIN	P09958	794 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	F3	P13726	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF28	P17035	718 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ARL4A	P40617	200 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	STC1	P52823	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CDH6	P55285	790 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	UBXN1	Q04323	297 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	FOXM1	Q08050	763 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445		A0A0G2JNG1	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SNX2	O60749	519 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ACP5	P13686	325 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SLC2A4	P14672	509 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	IL1R2	P27930	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	EPHB1	P54762	984 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	GFER	P55789	205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	POLH	Q9Y253	713 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	RFPL1	O75677	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	CLDN7	O95471	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	C9	P02748	559 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	SERPINB6	P35237	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	PCK1	P35558	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ITK	Q08881	620 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	IHH	Q14623	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	HSPH1	Q92598	858 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	WDR24	Q96S15	920 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-208	ENST00000430445	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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