RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHOXF1Q8NHV9 184 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNAPC3Q92966 411 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLPBQ9H078 707 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMYD2Q9NRG4 433 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 BAG5Q9UL15 447 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNPY2Q9Y2B0 182 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 A3GALT2U3KPV4 340 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASB14A6NK59 587 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 C17orf100A8MU93 164 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 G6PDP11413 515 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCCP23508 829 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RYKP34925 604 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDIT3P35638 169 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPN9P43378 593 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RUNDC3AQ59EK9 446 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 XRRA1Q6P2D8 792 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAD9BQ6WBX8 426 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RINLQ6ZS11 566 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC25A42Q86VD7 318 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 LONP2Q86WA8 852 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC33Q8N5R6 958 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 POC5Q8NA72 575 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAAF1Q8NEP3 725 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SSC4DQ8WTU2 575 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC38A5Q8WUX1 472 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF799Q96GE5 643 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH3GL2Q99962 352 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 DGCR6LQ9BY27 220 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF186Q9NXI6 227 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 LZTS1Q9Y250 596 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAKO14976 1311 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 E2F8A0AVK6 867 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM49BA6NDI0 452 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 EFCAB8A8MWE9 144 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLRF2D3W0D1 207 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLDN1O95832 211 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NGFP01138 241 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 AVPR2P30518 371 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NR1H2P55055 460 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 AP5B1Q2VPB7 878 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLD3Q8IV08 490 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HACE1Q8IYU2 909 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SETD9Q8NE22 299 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLCO2A1Q92959 643 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHKBQ93100 1093 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC45A3Q96JT2 553 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUP62CLQ9H1M0 184 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOD2Q9HC29 1040 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NECTIN3Q9NQS3 549 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 THAP1Q9NVV9 213 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PPC4 97 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERVV-1B6SEH8 477 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAP00813 363 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 P0C879 139 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF17P17021 662 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NR2F2P24468 414 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HALP42357 657 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDK7P50613 346 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSDMDP57764 484 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALCOCO2Q13137 446 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 LY6DQ14210 128 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM102BQ5T8I3 360 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTSS1LQ765P7 747 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 VASH2Q86V25 355 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TPH2Q8IWU9 490 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM156AQ8NDB6 213 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 THAP6Q8TBB0 222 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUSD6Q92537 303 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 BADQ92934 168 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCYT2Q99447 389 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYD88Q99836 296 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDF15Q99988 308 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYTL1Q9NRR1 136 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN16Q9UKR8 245 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CORO2BQ9UQ03 480 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms