RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 HCN1O60741 890 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 HOXC6P09630 235 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SDC2P34741 201 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZFP69Q49AA0 526 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CERCAMQ5T4B2 595 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CADM2Q8N3J6 435 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OR2L5Q8NG80 312 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FAM81AQ8TBF8 368 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OR8D1Q8WZ84 308 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DNASE1L2Q92874 299 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DIRAS2Q96HU8 199 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CEP295NLQ96MC4 621 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PPM1MQ96MI6 270 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KCNN2Q9H2S1 579 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 A0A075B6Q4 140 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CARTPTQ16568 116 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GLYATQ6IB77 296 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF613Q6PF04 617 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PQLC1Q8N2U9 271 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KAT2AQ92830 837 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CDT1Q9H211 546 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PHF24Q9UPV7 400 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 BBIP1A8MTZ0 92 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 IGFBP5P24593 272 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R40P59535 323 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MYO19Q96H55 970 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ASTN1O14525 1302 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CHST10O43529 356 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CABYRO75952 493 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MTTPP55157 894 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DPYSQ14117 519 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SMU1Q2TAY7 513 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DUPD1Q68J44 220 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ACSS2Q9NR19 701 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MGAT4AQ9UM21 535 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CCNDBP1O95273 360 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CIB1Q99828 191 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ABCG4Q9H172 646 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 YDJCA8MPS7 323 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CYP3A4P08684 503 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF221Q9UK13 617 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 BCKDKO14874 412 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RGS10O43665 173 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TLR5O60602 858 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MATN4O95460 622 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MATKP42679 507 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GTF2BQ00403 316 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CREMQ03060 361 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SLC9A6Q92581 669 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TCF25Q9BQ70 676 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KCNA5P22460 613 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DNASE1L1P49184 302 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RAB43Q86YS6 212 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MTMR9Q96QG7 549 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MSRAQ9UJ68 235 aa15.99■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CLUHO75153 1309 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DNTTP04053 509 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NUDT17P0C025 328 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ICAM3P32942 547 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NOMO3P69849 1222 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MC1RQ01726 317 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms