RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snrnp48	Q9D361	337 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Thegl	Q9DA15	459 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Morf4l2	Q9R0Q4	288 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt6b	Q9Z331	562 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Triobp	Q99KW3	2014 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hs3st1	O35310	311 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpr3	P35413	330 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clec4f	P70194	548 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trappc9	Q3U0M1	1148 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Six3	Q62233	333 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube2q1	Q7TSS2	422 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ostm1	Q8BGT0	338 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aldh4a1	Q8CHT0	562 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Spp2	Q8K1I3	203 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr1353	Q8VGU8	309 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snrpb2	Q9CQI7	225 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tma16	Q9CR02	221 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	L3hypdh	Q9CXA2	354 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cog8	Q9JJA2	640 aa		27.71	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Umodl1	Q5DID3	1319 aa		27.7	■■■□□ 2.03
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Erich1	E9PY43	332 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Psme3	P61290	254 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdkl4	Q3TZA2	342 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lcorl	Q3U285	600 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hexdc	Q3U4H6	486 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dennd2c	Q6P9P8	914 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Svopl	Q6PDF3	494 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fgb	Q8K0E8	481 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Glcci1	Q8K3I9	537 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gtf2ird2	Q99NI3	936 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Upk1a	Q9D132	257 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Exoc2	Q9D4H1	924 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crot	Q9DC50	612 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tagln3	Q9R1Q8	199 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fhl5	Q9WTX7	284 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Papolb	Q9WVP6	641 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dnpep	Q9Z2W0	473 aa		27.7	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Baz2b	A2AUY4	2123 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Azin1	O35484	448 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wap	P01173	134 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pim3	P58750	326 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stx1b	P61264	288 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Naa20	P61600	178 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbtb16	Q3UQ17	673 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crhr2	Q60748	411 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hadha	Q8BMS1	763 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nmur2	Q8BZ39	395 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bhlhe22	Q8C6A8	355 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zdhhc7	Q91WU6	308 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rnf31	Q924T7	1066 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mpst	Q99J99	297 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ddx50	Q99MJ9	734 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp3a44	Q9EQW4	504 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbed6	D2EAC2	980 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tsga10ip	F7A1F0	157 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gnat1	P20612	350 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hmgcl	P38060	325 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prpf38b	Q80SY5	542 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	H2-M10.2	Q85ZW9	329 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr273	Q8VG87	317 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sarnp	Q9D1J3	210 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tchhl1	Q9D3P1	638 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp2g1	Q9WV19	494 aa		27.69	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Obsl1	D3YYU8	1804 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mageb4	A2A9R3	556 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ssxb6	A2BI74	170 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Selenov	D3YXG1	328 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmn2r85	G3UW56	850 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ebf3	O08791	596 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aff3	P51827	1254 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam126a	Q6P9N1	521 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam107a	Q78TU8	144 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Shc2	Q8BMC3	573 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abi3	Q8BYZ1	367 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Panx3	Q8CEG0	392 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap61	Q8CEL2	1252 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lypd3	Q91YK8	363 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	L2hgdh	Q91YP0	464 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cmc1	Q9CPZ8	106 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Phf10	Q9D8M7	497 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Poc5	Q9DBS8	558 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dpysl5	Q9EQF6	564 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gde1	Q9JL56	331 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ptk2b	Q9QVP9	1009 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mgam	B5THE2	1827 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smo	P56726	793 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam83e	Q80XS7	481 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmn1r213	Q8R278	384 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Catsper1	Q91ZR5	686 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Def8	Q99J78	448 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tnip2	Q99JG7	430 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ak1	Q9R0Y5	194 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Insl5	Q9WUG6	135 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ap4s1	Q9WVL1	144 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pikfyve	Q9Z1T6	2097 aa		27.68	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ralgps1	A2AR50	585 aa		27.67	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rab17	P35292	214 aa		27.67	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adamts8	P57110	905 aa		27.67	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rpl26	P61255	145 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ids	Q08890	552 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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