RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 SMIM14Q96QK8 99 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 KLK10O43240 276 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MMP2P08253 660 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ACTR1BP42025 376 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR3P46089 330 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 NR2C2P49116 596 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SPINT3P49223 89 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ACTR1AP61163 376 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TFDP2Q14188 446 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 NR1D2Q14995 579 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC14A2Q15849 920 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC30A9Q6PML9 568 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM5Q9C035 493 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS18Q9P253 973 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TK2O00142 265 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PSTPIP1O43586 416 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ASMTLO95671 621 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ECEL1O95672 775 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CPNE6O95741 557 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 JMJD7P0C870 316 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 COMTP21964 271 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 UGT1A5P35504 534 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGEA1P43355 309 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CXADRP78310 365 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 B4GALNT1Q00973 533 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MAP9Q49MG5 647 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PYCR3Q53H96 274 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PIM3Q86V86 326 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 AGAP3Q96P47 875 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 AGAP2Q99490 1192 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CMKLR1Q99788 373 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 RMI1Q9H9A7 625 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 RAD18Q9NS91 495 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 BPTFQ12830 3046 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 INPP4BO15327 924 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TNNT1P13805 278 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 DYNLT1P63172 113 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TAZQ16635 292 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TEX44Q53QW1 395 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 NPNTQ6UXI9 565 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM74Q86UV6 250 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC170Q8IYT3 715 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 NAGSQ8N159 534 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TC2NQ8N9U0 490 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIB3Q96RU7 358 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ALG6Q9Y672 507 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 MTSS1O43312 755 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 B4GAT1O43505 415 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 LCA5LO95447 670 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ALDH4A1P30038 563 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CDKN2BP42772 138 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 OR1D5P58170 312 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CDK18Q07002 472 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 GALNT3Q14435 633 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SPA17Q15506 151 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 JAMLQ86YT9 394 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 188.6 ms