RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DLL4Q9NR61 685 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GMEB1Q9Y692 573 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 AREL1O15033 823 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GRID2O43424 1007 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SNAP91O60641 907 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GABBR2O75899 941 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ZNF28P17035 718 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CD58P19256 250 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CFAP58Q5T655 872 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCDC181Q5TID7 509 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 INPP5DQ92835 1189 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 C14orf79Q96F83 325 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB11Q96P15 392 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NUDT9Q9BW91 350 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ING2Q9H160 280 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NDST4Q9H3R1 872 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CHST11Q9NPF2 352 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 VPS28Q9UK41 221 aa11.68□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RTTNQ86VV8 2226 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 PIPSLA2A3N6 862 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LRRD1A4D1F6 860 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CLIC2O15247 247 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RNF8O76064 485 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 FYNP06241 537 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 STSP08842 583 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LINGO3P0C6S8 592 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ART1P52961 327 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DNASE1L3Q13609 305 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 UGT8Q16880 541 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ZNF394Q53GI3 561 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCDC63Q8NA47 563 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 THAP4Q8WY91 577 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ARL8AQ96BM9 186 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 FGF22Q9HCT0 170 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ACSS2Q9NR19 701 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 PANK4Q9NVE7 773 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 VPS51Q9UID3 782 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.67□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 F5H5T6 163 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 KATNA1O75449 491 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DRAP01903 254 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 HTR1EP28566 365 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ALDH3A1P30838 453 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCL11P51671 97 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DLG4P78352 724 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TAC4Q86UU9 113 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IFT20Q8IY31 132 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IRGQQ8WZA9 623 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IQCDQ96DY2 449 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 WDR92Q96MX6 357 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.66□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ACTL8Q9H568 366 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms