RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 EXD1Q8NHP7 514 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KRT35Q92764 455 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GLOD4Q9HC38 313 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KCND1Q9NSA2 647 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SUFUQ9UMX1 484 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KNTC1P50748 2209 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC66A2RUB6 948 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 F5H423 210 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MPOP05164 745 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM5P06731 702 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PTPN3P26045 913 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TEAD1P28347 426 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDC25BP30305 580 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ACTN2P35609 894 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SPINT3P49223 89 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 VAV2P52735 878 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RWDD2BP57060 319 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 COPS2P61201 443 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCL7P80098 99 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CBX1P83916 185 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDK18Q07002 472 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ADCY2Q08462 1091 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PEX6Q13608 980 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ISXQ2M1V0 245 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ALS2CLQ60I27 953 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM74Q86UV6 250 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NLRP8Q86W28 1048 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KYQ8NBH2 561 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 WDR48Q8TAF3 677 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 TEKT5Q96M29 485 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LYSMD1Q96S90 227 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP2Q99490 1192 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDH19Q9H159 772 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RP1P56715 2156 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.27□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 HACD1B0YJ81 288 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZW10O43264 779 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TCEA3O75764 348 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TJP3O95049 919 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NDST3O95803 873 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 APOC2P02655 101 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FUCA1P04066 466 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GLB1P16278 677 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NFKB1P19838 968 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FECHP22830 423 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ADCY8P40145 1251 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR1BP42025 376 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR1AP61163 376 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GABREP78334 506 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CTBSQ01459 385 aa8.27□□□□□ -1.09
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