RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530003.5

RPS6KA1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5 BASIC

Gene RPS6KA1, Length 3,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CD1D	P15813	335 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	IMPDH1	P20839	514 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MAP7	Q14244	749 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ACAP2	Q15057	778 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SERPINB11	Q96P15	392 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003		A8MX80	341 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	IRF1	P10914	325 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TM4SF4	P48230	202 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SEMG2	Q02383	582 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PRKCQ	Q04759	706 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LZTR1	Q8N653	840 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CALML6	Q8TD86	181 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	AP3B1	O00203	1094 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	BTN3A1	O00481	513 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	AZIN1	O14977	448 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MAGEB3	O15480	346 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NIPSNAP2	O75323	286 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	KATNA1	O75449	491 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HERVK_113	P63132	956 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HERC3	Q15034	1050 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DLG3	Q92796	817 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	GPR21	Q99679	349 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	POLG2	Q9UHN1	485 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	STAMBP	O95630	424 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MTHFD2	P13995	350 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	GPX3	P22352	226 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	GALK1	P51570	392 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	DNAJB13	P59910	316 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	UFM1	P61960	85 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RBBP7	Q16576	425 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RANBP9	Q96S59	729 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NACA2	Q9H009	215 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CMTM6	Q9NX76	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ASL	P04424	464 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ZNF24	P17028	368 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	TMED1	Q13445	227 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	NFYC	Q13952	458 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	KCNA10	Q16322	511 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RPS6KA1-216	ENST00000530003	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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