RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 OLFM2O95897 454 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GFAPP14136 432 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FGFR3P22607 806 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GRK2P25098 689 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HTR7P34969 479 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA6P43360 314 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NDST2P52849 883 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NAB1Q13506 487 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MAPRE2Q15555 327 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ8Q15842 424 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TXNDC8Q6A555 127 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TBATAQ96M53 351 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM161BQ96MY7 647 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RHOJQ9H4E5 214 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM50BQ9Y247 325 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OR51F1A6NGY5 319 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SOBPA7XYQ1 873 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BAIAP3O94812 1187 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 UNC5CO95185 931 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MT-CO1P00395 513 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CYBBP04839 570 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MPOP05164 745 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CLTBP09497 229 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PSMA3P25788 255 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC18A1P54219 525 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 IRF9Q00978 393 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RUNX1T1Q06455 604 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A1Q13621 1099 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PARP15Q460N3 678 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TTC7BQ86TV6 843 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NSL1Q96IY1 281 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD11Q96NU1 681 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 VPS35Q96QK1 796 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MARCH7Q9H992 704 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 VPS45Q9NRW7 570 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 XPR1Q9UBH6 696 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CFLARO15519 480 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 COCHO43405 550 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT7LO94864 414 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL2O95198 593 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL14O95715 111 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 KRT20P35900 424 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 NEK3P51956 506 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB103AP81534 67 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNEQ04844 493 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRCAPQ14761 206 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM135Q86UB9 458 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM199Q8N511 208 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TSGA13Q96PP4 275 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 COPG2Q9UBF2 871 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf78A6NCI8 922 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN11O75508 207 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RHOBTB1O94844 696 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 OR5F1O95221 314 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 BAG2O95816 211 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 AHSGP02765 367 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CHRM3P20309 590 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RCVRNP35243 200 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 PTGS2P35354 604 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 PGM1P36871 562 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KA2Q15349 733 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-208ENST00000519076 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms