RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAOK1Q7L7X3 1001 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ISCA2Q86U28 154 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 HACE1Q8IYU2 909 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM178AQ8NBL3 297 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 THAP6Q8TBB0 222 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNG4Q8TDN1 519 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IQCDQ96DY2 449 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIPOR3Q96MK2 946 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FUCA2Q9BTY2 467 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 HDHD5Q9BXW7 423 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 STK33Q9BYT3 514 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC134Q9H6E4 229 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDE11AQ9HCR9 933 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTPRCP08575 1304 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAF1P21675 1872 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 COL1A2P08123 1366 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A087WZ62 844 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM168BA1KXE4 195 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SERPINE3A8MV23 424 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MPTX1A8MV57 137 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCAM2O15394 837 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGS11O94810 467 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CER1O95813 267 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLP2RO95838 553 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHV4-59P01825 116 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYBP10242 640 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP4B1P13584 511 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FASLGP48023 281 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RCAN1P53805 252 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CACNB3P54284 484 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 EVA1CP58658 441 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF6Q15052 776 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAPKAPK3Q16644 382 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 APOA5Q6Q788 366 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC36A4Q6YBV0 504 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RINLQ6ZS11 566 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SESTD1Q86VW0 696 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM186BQ8IYM0 893 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS52Q8N1B4 723 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 C2CD4CQ8TF44 421 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLEC4CQ8WTT0 213 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SUSD6Q92537 303 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 STAMQ92783 540 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNAPC3Q92966 411 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTMR8Q96EF0 704 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SGF29Q96ES7 293 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RHNO1Q9BSD3 238 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 HAUS8Q9BT25 410 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCDHAC1Q9H158 963 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM60Q9H2L4 133 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 COQ3Q9NZJ6 369 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FLRT3Q9NZU0 649 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 UPB1Q9UBR1 384 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL17BQ9UHF5 180 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMCHD1A6NHR9 2005 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANO9A1A5B4 782 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 TUSC2O75896 110 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGKV1-17P01599 117 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 HSPA6P17066 643 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ELK1P19419 428 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDK18Q07002 472 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTK2BQ14289 1009 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPE65Q16518 533 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 UTF1Q5T230 341 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAP1GAP2Q684P5 730 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF534Q76KX8 674 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 BEND5Q7L4P6 421 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF144BQ7Z419 303 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 FOXRED2Q8IWF2 684 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHC2Q8IXK0 858 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-162P-201ENST00000516228 EID3Q8N140 333 aa0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms