RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 LVRNQ6Q4G3 990 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDELC1Q6UW63 502 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZVL8 140 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAF8Q7Z7C8 310 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PELI3Q8N2H9 469 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 TLR10Q9BXR5 811 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP4F12Q9HCS2 524 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PADI4Q9UM07 663 aa19.15■□□□□ 0.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRSS38A1L453 326 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNFRSF10CO14798 259 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDST3O95803 873 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM23P36406 574 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR1P46091 355 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 WNT3AP56704 352 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTSQ03393 145 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PERM1Q5SV97 790 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDCP2Q5VXM1 449 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC35B2Q8TB61 432 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC110Q8TBZ0 833 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA13Q96N96 652 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGR4Q9BXB1 951 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa19.14■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZSCAN12O43309 604 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLDN7O95471 211 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIRTP0C851 137 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMB4P28070 264 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDK3Q00526 305 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 MPP3Q13368 585 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPIDRQ14159 915 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTP5Q14D33 572 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 C19orf48Q6RUI8 117 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 REXO1L1PQ8IX06 675 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 IPMKQ8NFU5 416 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR48Q8TAF3 677 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRGPRX2Q96LB1 330 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC3Q9BQI4 270 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD84Q9UIB8 345 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LHX6Q9UPM6 363 aa19.13■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCN8AQ9UQD0 1980 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 B4DGG1 531 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRINP1O60477 761 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP12O75317 370 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC4A1P02730 911 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCTD16Q68DU8 428 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC70Q6NSX1 233 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM71DQ8N9W8 422 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC74AQ96AQ1 378 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 AP2M1Q96CW1 435 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FSD1LQ9BXM9 530 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM168Q9H0V1 697 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF711Q9Y462 761 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPSM3Q9Y4H4 160 aa19.12■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM208BQ5VWN6 2430 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCEA3O75764 348 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANXA9O76027 345 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PYGLP06737 847 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACTN2P35609 894 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNPDA1P46926 289 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GEMP55040 296 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GDF10P55107 478 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GABREP78334 506 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 DOK6Q6PKX4 331 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM46DQ8NEK8 389 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR6C4Q8NGE1 309 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCAMP4Q969E2 229 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX101Q9BY14 249 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCG8Q9H221 673 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPEP2Q9H4A9 486 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHOC2Q9UQ13 582 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPO11Q9Y5K1 396 aa19.11■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 C5orf60A6NFR6 353 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 LIASO43766 372 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOD1P00441 154 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 EPOP01588 193 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 MPOP05164 745 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms