RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 AHCYP23526 432 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CAPZA2P47755 286 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -25e-7■■□□□ 13.3
CCSAP-202ENST00000366686 OAZ1P54368 228 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RRP1P56182 461 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ERVFRD-1P60508 538 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEP78395 509 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP27A1Q02318 531 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TLE3Q04726 772 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NEDD9Q14511 834 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBR1Q16650 682 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT27Q7Z3Y8 459 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AACSQ86V21 672 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARL14Q8N4G2 192 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC150Q8NCX0 1101 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EDARADDQ8WWZ3 215 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNF31Q96EP0 1072 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DYDC2Q96IM9 177 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CAMK1GQ96NX5 476 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDADC1Q9BWV3 514 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 S1PR5Q9H228 398 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GDAP2Q9NXN4 497 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP97Q9P2B7 532 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DDX19BQ9UMR2 479 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDYLQ9Y232 598 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ELOVL7A1L3X0 281 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 XKRY2A2RUG3 117 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB13A6NJU9 1138 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB5A8MRT5 1133 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB4C9JG80 1138 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ST8SIA5O15466 376 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NKX2-8O15522 239 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HSF2BPO75031 334 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GDF11O95390 407 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT5P13647 590 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDGFRAP16234 1089 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FUT1P19526 365 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PON1P27169 355 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CASRP41180 1078 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TXKP42681 527 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNA2P51530 1060 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ERVFC1P60507 584 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OLIG2Q13516 323 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 INSCQ1MX18 579 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPDYCQ5MJ68 293 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP40Q5TG30 622 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MPZL3Q6UWV2 235 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IGDCC3Q8IVU1 814 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CPA5Q8WXQ8 436 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TEKT1Q969V4 418 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 WDYHV1Q96HA8 205 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 APOL6Q9BWW8 343 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PCMTD2Q9NV79 361 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM90A10PA6NDY2 464 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC53A6NM62 1247 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8RI6L899 631 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH1A2O94788 518 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PAHP00439 452 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LYL1P12980 280 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 INSRRP14616 1297 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM11P17152 192 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCND2P30279 289 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HAND2P61296 217 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TAP2Q03519 686 aa2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT3Q14435 633 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms