RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13128L7MU96 475 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GzmkO35205 263 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr2iP60898 125 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MylpfP97457 169 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtscP97821 462 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdr16c6Q05A13 316 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tespa1Q3U132 458 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsrp1Q3UC65 298 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lsmem1Q3UQS2 128 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam20cQ5MJS3 579 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r14bQ62084 147 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc8eQ66JT1 795 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SvoplQ6PDF3 494 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb24Q80X44 710 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfn1Q811U4 741 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TufmQ8BFR5 452 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr21Q8BX79 349 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps50Q8CI71 964 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr866Q8VFI7 312 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr617Q8VGA1 318 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem80Q9D3H0 123 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NckipsdQ9ESJ4 714 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plscr1Q9JJ00 328 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thap11Q9JJD0 305 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scamp5Q9JKD3 235 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ninj2Q9JL89 143 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsk3bQ9WV60 420 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2afb2S4R1M3 115 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13276A0A087WR18 182 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itih4A6X935 942 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20828J3KMI7 228 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Azin1O35484 448 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpst1O70281 370 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a20bO88575 635 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apoa4P06728 395 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp14P10755 501 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drd4P51436 387 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pim3P58750 326 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alg6Q3TAE8 507 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magee2Q52KG3 523 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q5XFZ0 217 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ntan1Q64311 310 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AtminQ6P9S1 818 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pnma8aQ80VM8 430 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp438Q8BFX2 798 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrn1lQ8C4W3 162 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syne4Q8CII8 388 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr570Q8VH12 312 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dio3Q91ZI8 304 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkxQ922R0 355 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mat2bQ99LB6 334 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi44lQ9BDB7 447 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddit4Q9D3F7 229 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc28a3Q9ERH8 703 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi30Q9ESY9 248 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kat2bQ9JHD1 813 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jam2Q9JI59 298 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpp6Q9JLB0 553 aa6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plxna4Q80UG2 1893 aa6.59□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prrt4B2RU40 902 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17175E9Q528 179 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EgfP01132 1217 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd4P06332 457 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpep1P31428 410 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 StacP97306 403 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc30a3P97441 388 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InipQ3TXT3 104 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgre1Q61549 931 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa17Q64016 82 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kir3dl2Q673W2 388 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d12Q6A039 696 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zzz3Q6KAQ7 910 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap206Q6PE87 622 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dclk2Q6PGN3 756 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr141Q7TQP0 305 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr813Q7TRH5 310 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgo2Q7TSY8 1164 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap11aQ80Y19 987 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amigo2Q80ZD9 519 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa6.58□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NcaphQ8C156 731 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms