RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-215ENST00000637266 SPON1Q9HCB6 807 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MIOSQ9NXC5 875 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 COPZ2Q9P299 210 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SYN3O14994 580 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 NRP2O60462 931 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC25A12O75746 678 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 FECHP22830 423 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC1A2P43004 574 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 USP46P62068 366 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 BTKQ06187 659 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF33BQ06732 778 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 GAS6Q14393 721 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 C17orf50Q8WW18 174 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 WDR70Q9NW82 654 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 DHRS7Q9Y394 339 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ILVBLA1L0T0 632 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 DCXO43602 365 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ATG13O75143 517 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SCGNO76038 276 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 GRIA4P48058 902 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SOX9P48436 509 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ARL6IP1Q15041 203 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 POF1BQ8WVV4 589 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MED28Q9H204 178 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 A0A1B0GVM2 712 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 BCKDKO14874 412 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TACSTD2P09758 323 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ADIGQ0VDE8 80 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SCARF1Q14162 830 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 OXR1Q8N573 874 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 KAT5Q92993 513 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC38A4Q969I6 547 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MRI1Q9BV20 369 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 WDR18Q9BV38 432 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLC22A4Q9H015 551 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SLIT2O94813 1529 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 FAM189A1O60320 539 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ARHGEF15O94989 841 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 PSEN2P49810 448 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 BNIP1Q12981 228 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 NEDD8Q15843 81 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 COQ5Q5HYK3 327 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 LAYNQ6UX15 382 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 RELL1Q8IUW5 271 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 DUSP16Q9BY84 665 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CCNB1P14635 433 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 HRH2P25021 359 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MNDAP41218 407 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CPA2P48052 419 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 SCNN1BP51168 640 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 MON1AQ86VX9 555 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.99□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CST1P01037 141 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CYP1B1Q16678 543 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.98□□□□□ -1.29
SCN2A-215ENST00000637266 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms