RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SSTR2P30874 369 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PEX5P50542 639 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 AP3M2P53677 418 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DAOAP59103 153 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CENPCQ03188 943 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IFT88Q13099 833 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CHAF1BQ13112 559 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PDCLQ13371 301 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TMED1Q13445 227 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LAMB3Q13751 1172 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NFATC4Q14934 902 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZACNQ401N2 412 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TTMPQ5BVD1 217 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 VPS36Q86VN1 386 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RNF34Q969K3 372 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TSC22D3Q99576 134 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZFATQ9P243 1243 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RNF14Q9UBS8 474 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 COX6B1P14854 86 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 MPSTP25325 297 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ALDH4A1P30038 563 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 L1CAMP32004 1257 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 MAN1A1P33908 653 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CYP2J2P51589 502 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 VAV2P52735 878 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 KRT83P78385 493 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CDK18Q07002 472 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CUL3Q13618 768 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IRF4Q15306 451 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 HHATQ5VTY9 493 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RESP18Q5W5W9 173 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CHSY1Q86X52 802 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 VOPP1Q96AW1 172 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 PSMB7Q99436 277 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 STK17AQ9UEE5 414 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 KLQ9UEF7 1012 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 VPS13CQ709C8 3753 aa11.7□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ANP32DO95626 131 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RRM1P23921 792 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CASP14P31944 242 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 GPR3P46089 330 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 FOXM1Q08050 763 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ADAM9Q13443 819 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ITIH4Q14624 930 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 NXPE1Q8N323 547 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 CCT6BQ92526 530 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 RAB7BQ96AH8 199 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.69□□□□□ -0.54
HCG18-241ENST00000602290 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms