RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567396.1

AC011939.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC011939.2, Length 428 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011939.2-201ENST00000567396 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.79□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 ZNHIT1O43257 154 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 CIDEAO60543 219 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 URODP06132 367 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 HEXAP06865 529 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 INHBAP08476 426 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 PATE4P0C8F1 98 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 MAOAP21397 527 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 RAD23BP54727 409 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 CDH15P55291 814 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 KRTAP10-3P60369 221 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 TMEM81Q6P7N7 255 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 OR52I2Q8NH67 350 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 LINGO1Q96FE5 620 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 SH3GL2Q99962 352 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 ITM2CQ9NQX7 267 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.78□□□□□ -1.96
AC011939.2-201ENST00000567396 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TEX22C9J3V5 150 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 CRLF1O75462 422 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 EGFP01133 1207 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TFP02787 698 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 IRF1P10914 325 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 NR1D1P20393 614 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 PGM1P36871 562 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GPD2P43304 727 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 MMP14P50281 582 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 FOXM1Q08050 763 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 UBE4AQ14139 1066 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 MORC3Q14149 939 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ZNF234Q14588 700 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TBC1D20Q96BZ9 403 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ELP4Q96EB1 424 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 QRFPRQ96P65 431 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 NEURL2Q9BR09 285 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TKTL2Q9H0I9 626 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 MMP25Q9NPA2 562 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 OGFRQ9NZT2 677 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.77□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 PTPRCP08575 1304 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 IFNL4K9M1U5 179 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 SYNGR3O43761 229 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GAGE5Q13069 117 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GAGE6Q13070 117 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 WDR38Q5JTN6 314 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 ATG16L1Q676U5 607 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 RRM2BQ7LG56 351 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GPR180Q86V85 440 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TRIM63Q969Q1 353 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 SCRN2Q96FV2 425 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 LRR1Q96L50 414 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 C17orf77Q96MU5 243 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 UBXN6Q9BZV1 441 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 POLG2Q9UHN1 485 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 HSF4Q9ULV5 492 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 KLHL20Q9Y2M5 609 aa2.76□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 A0A0G2JLW4 131 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 NCAM2O15394 837 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 SPINT2O43291 252 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 SEC14L5O43304 696 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GUCY1B2O75343 617 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 IGHV4-39P01824 125 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 FAM106CPP0CH98 169 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 DCTP40126 519 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GRK6P43250 576 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 TRAPPC10P48553 1259 aa2.75□□□□□ -1.97
AC011939.2-201ENST00000567396 GNAQP50148 359 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms