RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CD19	P15391	556 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR7	P34969	479 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMC4	P43686	418 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA2	P48052	419 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ME1	P48163	572 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NPY4R	P50391	375 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BMX	P51813	675 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MVD	P53602	400 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2	P54278	862 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MFAP4	P55083	255 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TLE3	Q04726	772 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB16	Q05516	673 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TEF	Q10587	303 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMK2D	Q13557	499 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PTK6	Q13882	451 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA25	Q14CX7	972 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MYLK3	Q32MK0	819 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT11	Q495W5	492 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP55	Q53EZ4	464 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf60	Q5U649	245 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CUZD1	Q86UP6	607 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO2A	Q92828	525 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RNFT2	Q96EX2	444 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS50	Q96JG6	964 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZPBP	Q9BS86	351 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MROH8	Q9H579	483 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GDE1	Q9NZC3	331 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PADI1	Q9ULC6	663 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CLRN2	A0PK11	232 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OOEP	A6NGQ2	149 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C76	A6NM76	312 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC169	A6NNP5	214 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		O00370	1275 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC30A4	O14863	429 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DDAH2	O95865	285 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRM4	P08173	479 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF2	P09038	288 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNA2	P20248	432 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP8	P22894	467 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP3A7	P24462	503 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF8	P28908	595 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HNF1B	P35680	557 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTM5	P46439	218 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRB2	P47870	512 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GATM	P50440	423 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB28	P51157	221 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR3	P51677	355 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PGD	P52209	483 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKQ	P52824	942 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GPC5	P78333	572 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ASIC1	P78348	528 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNB1	P98172	346 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ID2	Q02363	134 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	COX10	Q12887	443 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NPRL3	Q12980	569 aa		2.86	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT88	Q13099	833 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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