RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	AURKA	O14965	403 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TMCC2	O75069	709 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SNAP29	O95721	258 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	AMH	P03971	560 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CHRM3	P20309	590 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SLC6A2	P23975	617 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	IL32	P24001	234 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SOX6	P35712	828 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ARL2	P36404	184 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BMPR1A	P36894	532 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ETV3	P41162	512 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ASPA	P45381	313 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HUNK	P57058	714 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KEAP1	Q14145	624 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ACAP2	Q15057	778 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RPS6KA2	Q15349	733 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	EMC1	Q8N766	993 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	FBXL20	Q96IG2	436 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ITM2B	Q9Y287	266 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		10.16	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	COL4A1	P02462	1669 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BTAF1	O14981	1849 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120		A0A0J9YYE9	177 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	OR5K3	A6NET4	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	INPP4B	O15327	924 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	EED	O75530	441 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GABBR2	O75899	941 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LTF	P02788	710 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CTRB1	P17538	263 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LBP	P18428	481 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HTR3A	P46098	478 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ACOT2	P49753	483 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MLLT10	P55197	1068 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KCNK10	P57789	538 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	OR2B6	P58173	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CDH17	Q12864	832 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ORC1	Q13415	861 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	AQP6	Q13520	282 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DNASE1L3	Q13609	305 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	POU6F1	Q14863	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CDON	Q4KMG0	1287 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF691	Q5VV52	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TMEM198	Q66K66	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	EID3	Q8N140	333 aa		10.15	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78

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