RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SEC14L5	O43304	696 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ISL1	P61371	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SORD	Q00796	357 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PQM1	296 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	COX7A2	P14406	83 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PAX1	P15863	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NR1D1	P20393	614 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PDE1B	Q01064	536 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NAE1	Q13564	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF234	Q14588	700 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	LITAF	Q99732	161 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	WDR1	O75083	606 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	IRF1	P10914	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GGT5	P36269	586 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GABRB2	P47870	512 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PIGT	Q969N2	578 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS1	P07477	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CAMK1	Q14012	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	DVL1	O14640	695 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HOXB5	P09067	269 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	DCT	P40126	519 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FASLG	P48023	281 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TLE2	Q04725	743 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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