RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 SAP25Q8TEE9 199 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAF4BQ92750 862 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TWNKQ96RR1 684 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP28Q96RU2 1077 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR10A5Q9H207 317 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM245Q9H330 911 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CUEDC2Q9H467 287 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PNPOQ9NVS9 261 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCML1Q9UN30 329 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEP83Q9Y592 693 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITPR1Q14643 2758 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PR48 441 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FITM1A5D6W6 292 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TLR4O00206 839 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MID1O15344 667 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GSC2O15499 205 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FFAR2O15552 330 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP6O43182 974 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 WIPF1O43516 503 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC28A2O43868 658 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NRP2O60462 931 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBL1XO60907 577 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SDC3O75056 442 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MT-CO3P00414 261 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 WNT1P04628 370 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CKMT2P17540 419 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNFAIP3P21580 790 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP1P29466 404 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC8A1P32418 973 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP2P42575 452 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 AFMP43652 599 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TKTL1P51854 596 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMPRSS3P57727 454 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 E2F1Q01094 437 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MGAT5Q09328 741 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NFATC3Q12968 1075 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ILKQ13418 452 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 LY6DQ14210 128 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SHBQ15464 509 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 STILQ15468 1287 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CST6Q15828 149 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZACNQ401N2 412 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 LIPIQ6XZB0 460 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP30Q70CQ3 517 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MISP3Q96FF7 219 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPM1MQ96MI6 270 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 BTBD2Q9BX70 525 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUMA1Q14980 2115 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 B8ZZF3 427 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 J3KRW8 73 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPTLC2O15270 562 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLK10O43240 276 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MPOP05164 745 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PYGLP06737 847 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 BRAFP15056 766 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTSSP25774 331 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD70P32970 193 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GCLMP48507 274 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms