RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
FAAP20-209ENST00000428120 NOTCH4Q99466 2003 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 H3BMM5 538 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 EPHA3P29320 983 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ASPHQ12797 758 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 FUT11Q495W5 492 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SEL1L3Q68CR1 1132 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TEX9Q8N6V9 391 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CD248Q9HCU0 757 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TDP1Q9NUW8 608 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GALPQ9UBC7 116 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 FIS1Q9Y3D6 152 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GRID2O43424 1007 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PSMA3P25788 255 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB13P59910 316 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SEMG2Q02383 582 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 FAM219BQ5XKK7 198 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 NAT14Q8WUY8 206 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ING5Q8WYH8 240 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HACD3Q9P035 362 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 IL17CQ9P0M4 197 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PKP3Q9Y446 797 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC3O15379 428 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GSC2O15499 205 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SRCP12931 536 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A3P40879 764 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SUOXP51687 545 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 EPHA5P54756 1037 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 RIPK1Q13546 671 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 MYLIPQ8WY64 445 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LMLNQ96KR4 655 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 BIRC8Q96P09 236 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 BBS2Q9BXC9 721 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TCF7L2Q9NQB0 619 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 MEI4A8MW99 385 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 DCXO43602 365 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 OR4D1Q15615 310 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 GPR21Q99679 349 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 NPHS1O60500 1241 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 IGSF6O95976 241 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN8P19075 237 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ACCSLQ4AC99 568 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ZSWIM9Q86XI8 627 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 OR2AP1Q8NGE2 309 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TCF12Q99081 682 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A3Q99726 388 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CEP290O15078 2479 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 NIPSNAP2O75323 286 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PFKLP17858 780 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 AOC1P19801 751 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HMGCLP35914 325 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 XIAPP98170 497 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 EML3Q32P44 896 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 FAM151BQ6UXP7 276 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 KDM1BQ8NB78 822 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0J9YYE9 177 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TRBC1P01850 177 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TTPAP49638 278 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TBCCQ15814 346 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC126Q96EE4 140 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TRANK1O15050 2925 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM24O15164 1050 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 HNF1BP35680 557 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-209ENST00000428120 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms