RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 FGF22Q9HCT0 170 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 TOR4AQ9NXH8 423 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 SPO11Q9Y5K1 396 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa17.97■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 LIASO43766 372 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 GCATO75600 419 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 SOD1P00441 154 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 TNFP01375 233 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 PYGLP06737 847 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 CTSEP14091 401 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 HLA-DPA1P20036 260 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 GDF10P55107 478 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC3Q13217 504 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 SLC1A5Q15758 541 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 PROX2Q3B8N5 592 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 WDR24Q96S15 920 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 DUSP23Q9BVJ7 150 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 FAM83DQ9H4H8 585 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 DGKBQ9Y6T7 804 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 CACNA1AO00555 2505 aa17.96■□□□□ 0.47
HERC3-205ENST00000426683 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TNFRSF10CO14798 259 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 AURKAO14965 403 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CEP104O60308 925 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TRIM16O95361 564 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 AGTP01019 485 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 FGF1P05230 155 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CXCR5P32302 372 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 SNX1Q13596 522 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TCEA2Q15560 299 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CCDC157Q569K6 752 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CLPBQ9H078 707 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CYP4F12Q9HCS2 524 aa17.95■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TPP1O14773 563 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 INPP4BO15327 924 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 METTL18O95568 372 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 FGGP02679 453 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ANXA6P08133 673 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CKMT2P17540 419 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ELOCQ15369 112 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 PARP6Q2NL67 630 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ALS2CLQ60I27 953 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 DOK6Q6PKX4 331 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 GPR26Q8NDV2 337 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 APOL2Q9BQE5 337 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TRABDQ9H4I3 376 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 RAD18Q9NS91 495 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 DOLKQ9UPQ8 538 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.94■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 PCNX2A6NKB5 2137 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 PRSS38A1L453 326 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 LMO7DNF2Z398 122 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 YY2O15391 372 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CEACAM5P06731 702 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 STIP1P31948 543 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ADRA1AP35348 466 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 POLD2P49005 469 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ACADVLP49748 655 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 DAB2P98082 770 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 OLIG2Q13516 323 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 SPARCL1Q14515 664 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 LONRF2Q1L5Z9 754 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 P3H1Q32P28 736 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 RANBP10Q6VN20 620 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 TRIM74Q86UV6 250 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 SLC35F6Q8N357 371 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 RTP4Q96DX8 246 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 HIC2Q96JB3 615 aa17.93■□□□□ 0.46
HERC3-205ENST00000426683 APOLD1Q96LR9 279 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms