RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFS3O75489 264 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTHFD2P13995 350 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN8P19075 237 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZXDBP98169 803 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFHBQ8N7U6 833 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC189A1A4V9 331 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAG2O95816 211 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARSAP15289 507 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB103AP81534 67 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DERL2Q9GZP9 239 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPG21Q9NZD8 308 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51B4Q9Y5P0 310 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFRA2O00451 464 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLFM2O95897 454 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MC4RP32245 332 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTRA3P83110 453 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRRQ15256 657 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TXNDC8Q6A555 127 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZNB5 142 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BIRC8Q96P09 236 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL21Q9HBE4 155 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRGBPQ9NV56 204 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK39Q9UEW8 545 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS51Q9UID3 782 aa18.65■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCHNA4D1U4 455 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAG3P18627 525 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH13P55290 713 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHOAP61586 193 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRNQ16849 979 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFKFB4Q16877 469 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC30BQ8N4P2 665 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1191Q96A73 305 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINI1Q99574 410 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPQQ9Y646 472 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBDO15205 165 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KERAO60938 352 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSKP41240 450 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTPAP49638 278 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH18Q13634 790 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SQLEQ14534 574 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANO7Q6IWH7 933 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG14Q96F25 216 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB2Q96Q27 587 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDRT15Q96T59 188 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR21Q99679 349 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR41Q9HAD4 459 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPIFA1Q9NP55 256 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.64■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX28O15482 410 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK14O94921 469 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDCP19113 662 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V0D1P61421 351 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3BP2P78314 561 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD51Q06609 339 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EML3Q32P44 896 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGGQ5H8A4 983 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GK5Q6ZS86 529 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms