RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 MANFP55145 182 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP8P85298 464 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CPTPQ5TA50 214 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FAM210AQ96ND0 272 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CCNDBP1O95273 360 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CRHR1P34998 444 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 HECTD2Q5U5R9 776 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PARGQ86W56 976 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 34
USP25-204ENST00000400183 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 A0A0J9YYE9 177 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FGBP02675 491 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ETS2P15036 469 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DGKZQ13574 1117 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TREML2Q5T2D2 321 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LIN54Q6MZP7 749 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KLHL35Q6PF15 583 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MYOCQ99972 504 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 EXD2Q9NVH0 621 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PLLPQ9Y342 182 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.48■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KRT33AO76009 404 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DLG2Q15700 870 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MPPE1Q53F39 396 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 EXO5Q9H790 373 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MAP10Q9P2G4 905 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TMCC2O75069 709 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MMP3P08254 477 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 GNPDA1P46926 289 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CYP4F2P78329 520 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CYP4F3Q08477 520 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NR1D2Q14995 579 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 HAT1O14929 419 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TLL1O43897 1013 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CCNE2O96020 404 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 C1RP00736 705 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NDST3O95803 873 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 XIAPP98170 497 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ITGA7Q13683 1181 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LPIN1Q14693 890 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AP3S1Q92572 193 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 COMMD9Q9P000 198 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SCN2BO60939 215 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TRBC1P01850 177 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RHOQP17081 205 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 HTR7P34969 479 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FAM171BQ6P995 826 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 KLHL24Q6TFL4 600 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 TSSK3Q96PN8 268 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SGK2Q9HBY8 427 aa18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LRIG2O94898 1065 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 LAG3P18627 525 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PBX1P40424 430 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FLT3LGP49771 235 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FOLH1Q04609 750 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FUT2Q10981 343 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CERS6Q6ZMG9 384 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 IQCKQ8N0W5 287 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 AIF1LQ9BQI0 150 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SSR3Q9UNL2 185 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 MFSD11O43934 449 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CHRNGP07510 517 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 SLC26A3P40879 764 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.46■□□□□ 0.55
USP25-204ENST00000400183 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms