RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361311.4

CLSTN1-201, Transcript of calsyntenin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN1, Length 4,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1-201ENST00000361311 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RAMP2O60895 175 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CD97P48960 835 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PHC1P78364 1004 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 BNC1Q01954 994 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SNAPC2Q13487 334 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF773Q6PK81 442 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SNTNA6NMZ2 147 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 FFAR3O14843 346 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 GPR42O15529 346 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CTSHP09668 335 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ODC1P11926 461 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 FIBCD1Q8N539 461 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.95■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MGAT4DA6NG13 374 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MYL12BO14950 172 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RECQL4O94761 1208 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 IFNA14P01570 189 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC5A2P31639 672 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MED22Q15528 200 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ITPKCQ96DU7 683 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 H0YJX3 145 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 YWHAQP27348 245 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 EFEMP1Q12805 493 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ACAP2Q15057 778 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 OPTCQ9UBM4 332 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 HES2Q9Y543 173 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 KRT87PA6NCN2 255 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 H3BRB1 525 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 EPN2O95208 641 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PGLSO95336 258 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 C4BPBP20851 252 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 NDST2P52849 883 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MAXP61244 160 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PTPRNQ16849 979 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF544Q6NX49 715 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 NOTOA8MTQ0 251 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 H3BN98 237 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 UBXN8O00124 270 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TUBA3CQ13748 450 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 KLHL12Q53G59 568 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CASP12Q6UXS9 341 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RAP2AP10114 183 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 LRRC58Q96CX6 371 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ELP3Q9H9T3 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TMBIM6P55061 237 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ITGA1P56199 1179 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ATP6V0D1P61421 351 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PIGGQ5H8A4 983 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 OR52E6Q96RD3 313 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 PEBP4Q96S96 227 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 HACL1Q9UJ83 578 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ABCB7O75027 752 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 ULK1O75385 1050 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 CYP2C18P33260 490 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 OLR1P78380 273 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 MS4A2Q01362 244 aa15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLSTN1-201ENST00000361311 COLEC12Q5KU26 742 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms