RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LAG3P18627 525 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 AKT2P31751 481 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TAB1Q15750 504 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DUPD1Q68J44 220 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GGA2Q9UJY4 613 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 IDO1P14902 403 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CPXM1Q96SM3 734 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PADI3Q9ULW8 664 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MYBL2P10244 700 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PRKG2Q13237 762 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SUV39H1O43463 412 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OR5F1O95221 314 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 COL1A2P08123 1366 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TRBC1P01850 177 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ANPEPP15144 967 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ADSSP30520 456 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB2Q8N680 514 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 WNT7AO00755 349 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN11O75508 207 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TSHRP16473 764 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MPSTP25325 297 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 NR1D2Q14995 579 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BSNDQ8WZ55 320 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 U3KQV3 271 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BIRC5O15392 142 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF21O75509 655 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PAX3P23760 479 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OMPP47874 163 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PDK3Q15120 406 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MZT2BQ6NZ67 158 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DEC1Q9P2X7 70 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ2P63252 427 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CPTPQ5TA50 214 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LMLNQ96KR4 655 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TSSK3Q96PN8 268 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf18Q9UK00 162 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FGF19O95750 216 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TTC23Q5W5X9 447 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NMUR1Q9HB89 426 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 HMG20AQ9NP66 347 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ATG13O75143 517 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MYL9P24844 172 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF132P52740 706 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NAA20P61599 178 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 IRGCQ6NXR0 463 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD5O75356 428 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 UNC5CO95185 931 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 WWP2O00308 870 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MED22Q15528 200 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 POTEHQ6S545 545 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.32■■□□□ 1.16
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