RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 HPS4Q9NQG7 708 aa11.61□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CDH7Q9ULB5 785 aa11.61□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 A0A0G2JND7 137 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 A0A0J9YVX5 310 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TTC34A8MYJ7 566 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 F8W8V4 182 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TULP3O75386 442 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NDST3O95803 873 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MT-ND3P03897 115 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SAT1P21673 171 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ADRA1DP25100 572 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DGKGP49619 791 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RAP1GDS1P52306 607 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ECT2LQ008S8 904 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DLG2Q15700 870 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CES5AQ6NT32 575 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 KLC3Q6P597 504 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CHST14Q8NCH0 376 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NXPE3Q969Y0 559 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 GDE1Q9NZC3 331 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SENP1Q9P0U3 644 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MAGEB16A2A368 324 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SOBPA7XYQ1 873 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LDB2O43679 373 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 AP2B1P63010 937 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB16Q05516 673 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SATL1Q86VE3 508 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CDKL2Q92772 493 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CATSPER2Q96P56 530 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TREX1Q9NSU2 369 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.6□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 HEATR9A2RTY3 570 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PRRT4C9JH25 899 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DNAJC6O75061 913 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 BAG2O95816 211 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ADH1CP00326 375 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 FGF1P05230 155 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TCF3P15923 654 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 HLA-DPA1P20036 260 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SOX9P48436 509 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PLK1P53350 603 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 EPHB1P54762 984 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SULT2A1Q06520 285 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 KRT72Q14CN4 511 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 GAB4Q2WGN9 574 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 HDAC10Q969S8 669 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SKA1Q96BD8 255 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 OTUB2Q96DC9 234 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LRCH3Q96II8 777 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TBATAQ96M53 351 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MARK1Q9P0L2 795 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 FETUBQ9UGM5 382 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 AP3B1O00203 1094 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TYROBPO43914 113 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MAGEC1O60732 1142 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 OR6B1O95007 311 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PAPLNO95428 1278 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CISD3P0C7P0 127 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC1A2P43004 574 aa11.59□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ARFIP2P53365 341 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms