RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TIMM44O43615 452 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 BAIAP3O94812 1187 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 KCNH1O95259 989 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ESRRBO95718 433 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CPB1P15086 417 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CCL23P55773 120 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RAB15P59190 212 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MPP1Q00013 466 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GALNT2Q10471 571 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MERTKQ12866 999 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GRM3Q14832 879 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 KCNMB4Q86W47 210 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ABI1Q8IZP0 508 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 BHMTQ93088 406 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TAMM41Q96BW9 452 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SPATA7Q9P0W8 599 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CDH7Q9ULB5 785 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 E9PAM4 449 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MAFKO60675 156 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 BCL10O95999 233 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CCNA2P20248 432 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SCAPQ12770 1279 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PERM1Q5SV97 790 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CLEC14AQ86T13 490 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GBA3Q9H227 469 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NT5MQ9NPB1 228 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 A0A0U1RQS6 177 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 SDHDO14521 159 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 CABYRO75952 493 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 HLA-DQB2P05538 268 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 APOA4P06727 396 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 ATP6V1B2P21281 511 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 JAK1P23458 1154 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 TAF10Q12962 218 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 BFSP2Q13515 415 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 MOGQ16653 247 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 KCTD11Q693B1 232 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 CCDC80Q76M96 950 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 OR2T34Q8NGX1 318 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 OR2T3Q8NH03 318 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 HDAC11Q96DB2 347 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 MUC3BQ9H195 1237 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 CROTQ9UKG9 612 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 UBDO15205 165 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 ATP6AP2O75787 350 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 SLC4A1P02730 911 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 AHSGP02765 367 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 NR4A1P22736 598 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 NFKBIAP25963 317 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 MAGEA12P43365 314 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 NFATC3Q12968 1075 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC27-201ENST00000317907 IHHQ14623 411 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms